Согласно подп. 3 п. 1 ст. 146 Налогового кодекса РФ со стоимости строительно-монтажных работ необходимо уплатить НДС. Стоимость таких работ, согласно пункту 2 статьи 159 Налогового кодекса РФ, необходимо определять исходя из всех фактических расходов на их выполнение.

В соответствии с пунктом 10 статьи 167 Налогового кодекса РФ моментом  определения налоговой базы при выполнении строительно-монтажных работ для собственного потребления является последний день месяца  каждого налогового периода.

Вычетам подлежат суммы налога, исчисленные налогоплательщиками при выполнении строительно-монтажных работ для собственного потребления. При этом, действует условие о том, что стоимость имущества, в отношении которого проводились строительно-монтажные работы, подлежит включению в расходы (в том числе через амортизационные отчисления) при исчислении налога на прибыль организаций .

Однако существует ограничение по возмещению такого НДС — возмещение производится только в том случае, если объект (иное имущество), в отношении которого выполнялись эти СМР, предназначен для осуществления облагаемых НДС операций.

В противном случае, если имущество используется для осуществления необлагаемых НДС операций (п. 2 ст. 170 НК РФ), суммы налога, исчисленные налогоплательщиком, подлежат включению в стоимость строительно-монтажных работ (в стоимость объекта).

Кроме того, п. 5 ст. 172 НК РФ говорит о том, что вычеты сумм налога, исчисленные налогоплательщиками при выполнении строительно-монтажных работ для собственного потребления производятся только по мере уплаты в бюджет исчисленного налога в соответствии со ст. 173 НК РФ.

Так как  суммы НДС при выполнении строительно-монтажных работ для собственного потребления исчисляются налогоплательщиками ежемесячно (ежеквартально), то и налоговые вычеты по этому основанию предоставляются с такой же периодичностью (при выполнении вышеперечисленных условий).

  Если изначально имущество, в отношении которого осуществлялись строительно-монтажные работы, использовалось для облагаемых НДС операций, соответственно, налогоплательщиком был применен налоговый вычет по п. 6 ст. 171 НК РФ, но в дальнейшем такое имущество используется для осуществления операций, указанных в п. 2 ст. 170 НК РФ, то ранее принятые к вычету суммы налога подлежат восстановлению.

Что касается отражения рассматриваемых операций в бухгалтерском учете, то схема проводок будет выглядеть следующим образом:

Дебет 10, 20, 08 — Кредит 60, 76 — приняты на учет приобретенные товары (материалы), выполненные работы (оказанные услуги), объекты незавершенного капитального строительства согласно счетам-фактурам поставщиков и подрядчиков, без НДС

Дебет 19/матер — Кредит 60, 76 — сумма НДС согласно счетам-фактурам по приобретенным товарно-материальным ценностям, работам и услугам, использованным для выполнения СМР для собственных нужд, объектам незавершенного капитального строительства;

Дебет 68 — Кредит 19/матер — налоговый вычет суммы НДС согласно счетам-фактурам по оприходованным товарно-материальным ценностям, работам и услугам, использованным для выполнения СМР для собственных нужд, объектам незавершенного капитального строительства;

Дебет 08 — Кредит 10, 20, 60, т.д. — осуществление строительно-монтажных работ по капитальному строительству объекта, который будет использоваться при осуществлении облагаемых НДС операций; фактические расходы (освоенные объемы), понесенные в отчетном месяце.

Дебет 19/смр — Кредит 68 — начислен НДС на сумму фактических расходов налогоплательщика на выполнение СМР за отчетный месяц;

В следующем месяце:

Дебет 68 — Кредит 51 — уплачена в бюджет сумма НДС, причитавшаяся к уплате в бюджет.

Дебет 68 — Кредит 19/смр — налоговый вычет суммы НДС, исчисленной и уплаченной в бюджет с фактических расходов налогоплательщика на выполнение СМР за отчетный месяц.

Дебет 01 — Кредит 08 — введение в эксплуатацию объекта, который будет использоваться при осуществлении облагаемых НДС операций, по фактическим расходам на строительство без НДС.